Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

• net.preibisch.legacy.io,
• net.preibisch.legacy.mpicbg,
• net.preibisch.legacy.registration.bead,
• net.preibisch.legacy.registration.bead.error,
• net.preibisch.legacy.registration.bead.laplace,
• net.preibisch.legacy.registration.detection,
• net.preibisch.legacy.registration.detection.descriptor,
• net.preibisch.legacy.registration.threshold,
• net.preibisch.legacy.segmentation,
• net.preibisch.mvrecon,
• net.preibisch.mvrecon.fiji,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.grid,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.metadatarefinement,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.patterndetector,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.apply,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.boundingbox,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interactive,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.global,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.pairwise,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.parameters,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.statistics,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.queryXML,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.boundingbox,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.bdv,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.interestpoint,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.registration,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.selection,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.viewneighbours,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.filemap2,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.smartspim,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.util,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.intensityadjust,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.pointspreadfunctions,
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults,
• net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset,
• net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter,
• net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render,
• net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.util,
• net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox,
• net.preibisch.mvrecon.process.chromaticabberation,
• net.preibisch.mvrecon.process.cuda,
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution,
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init,
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration,
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.mul,
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.sequential,
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.normalization,
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.util,
• net.preibisch.mvrecon.process.downsampling,
• net.preibisch.mvrecon.process.downsampling.lazy,
• net.preibisch.mvrecon.process.export,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.tps,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.mpicbg,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensityadjust,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.lazy,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.tps,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.grid,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weightcombination,
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods.dog,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods.lazygauss,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.convergence,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.linkremoval,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.strong,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.weak,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.grouping,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.overlap,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.range,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.centerofmass,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.fastrgldm,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.geometrichashing,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.icp,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.loadcorrespondences,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.ransac,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.rgldm,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval,
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.histogram,
• net.preibisch.mvrecon.process.n5api,
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.icp,
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor,
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.exception,
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.matcher,
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.model,
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.similarity,
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.test,
• net.preibisch.mvrecon.process.psf,
• net.preibisch.mvrecon.process.quality,
• net.preibisch.mvrecon.process.splitting,
• net.preibisch.mvrecon.vecmath,
• util

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • javax.swing.AbstractAction (implements javax.swing.Action, java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
    • org.scijava.ui.behaviour.util.AbstractNamedAction
      • bdv.tools.ToggleDialogAction
        • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.bdv.ToggleDialogActionBrightness
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.statistics.SelectTimepointEntry
  • net.imglib2.AbstractEuclideanSpace (implements net.imglib2.EuclideanSpace)
    • net.imglib2.AbstractInterval (implements net.imglib2.Interval)
      • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.Block
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.FlatFieldCorrectedRandomAccessibleInterval<O,T,S,R> (implements net.imglib2.RandomAccessibleInterval<T>)
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.VirtuallyNormalizedRandomAccessibleInterval<T> (implements net.imglib2.RandomAccessibleInterval<T>)
    • net.imglib2.AbstractLocalizableInt (implements net.imglib2.Localizable)
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.AbstractTransformedIntervalRandomAccess (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
        • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.AbstractTransformedImgRandomAccess<T>
          • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.InterpolatingNonRigidRandomAccess<T>
          • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.NonRigidRandomAccess<T>
          • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.TransformedInputRandomAccess<T>
        • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.DistanceVisualizingRandomAccess
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weightcombination.CombineWeightsRandomAccess (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
        • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weightcombination.CombineWeightsMulRandomAccess
        • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weightcombination.CombineWeightsSumRandomAccess
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.FusedRandomAccess (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
        • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.util.FusedNonZeroRandomAccess
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.FusedRandomAccessFirstWins (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.FusedRandomAccessMax (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.FusedRandomAccessNoWeights (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.InterpolatingNonRigidRasteredRandomAccess<T> (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.NonRigidRasteredRandomAccess<T> (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
      • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.normalization.NormalizingRandomAccess<T> (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.TransformedInputGeneralRandomAccess<T> (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.TransformedRasteredRandomAccess<T> (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.grid.VirtualGridRandomAccess (implements net.imglib2.RandomAccess<T>)
    • net.imglib2.AbstractRealLocalizable (implements net.imglib2.RealLocalizable)
      • net.imglib2.RealPoint (implements net.imglib2.RealPositionable)
        • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.IntegratingNeighborSearchInterpolator<T> (implements net.imglib2.RealRandomAccess<T>)
        • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.NonWastefulRealPoint
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.AbstractImgLoader (implements mpicbg.spim.data.legacy.LegacyImgLoader<T>)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.AbstractImgFactoryImgLoader
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.LegacyFileMapImgLoaderLOCI
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.LegacyLightSheetZ1ImgLoader
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.LegacyStackImgLoader
        • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.LegacyStackImgLoaderIJ
        • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.LegacyStackImgLoaderLOCI
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.LegacyDHMImgLoader
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.LegacyMicroManagerImgLoader
  • mpicbg.models.AbstractModel<M> (implements mpicbg.models.Model<M>, java.io.Serializable)
    • mpicbg.models.AbstractAffineModel1D<M> (implements mpicbg.models.Affine1D<T>, mpicbg.models.InvertibleBoundable)
      • mpicbg.models.AffineModel1D (implements mpicbg.models.InvertibleBoundable)
        • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.mpicbg.FastAffineModel1D
    • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.model.TranslationInvariantModel<M>
      • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.model.FixedModel
      • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.model.TranslationInvariantAffineModel3D
      • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.model.TranslationInvariantFixedModel
      • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.model.TranslationInvariantRigidModel2D
      • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.model.TranslationInvariantRigidModel3D
      • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.model.TranslationInvariantSimilarityModel3D
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.AbstractPointDescriptor<P,F>
    • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.LocalCoordinateSystemPointDescriptor<P> (implements net.imglib2.RealLocalizable)
    • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.ModelPointDescriptor<P>
    • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.SimplePointDescriptor<P>
    • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.TranslationInvariantLocalCoordinateSystemPointDescriptor<P> (implements net.imglib2.RealLocalizable)
  • mpicbg.spim.data.generic.AbstractSpimData<S>
    • mpicbg.spim.data.SpimData
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.SpimData2
  • javax.swing.table.AbstractTableModel (implements java.io.Serializable, javax.swing.table.TableModel)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.FilteredAndGroupedTableModel<AS> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ISpimDataTableModel<AS>)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.interestpoint.InterestPointTableModel (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.interestpoint.InterestPointOverlay.InterestPointSource)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.registration.RegistrationTableModel
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.AbstractTransformedIntervalRandomAccessible (implements net.imglib2.RandomAccessible<T>)
    • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.AbstractTransformedImgRandomAccessible<T>
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.InterpolatingNonRigidRandomAccessible<T>
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.NonRigidRandomAccessible<T>
      • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.TransformedInputRandomAccessible<T>
    • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.DistanceVisualizingRandomAccessible
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.normalization.AdjustInput
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.parameters.AdvancedRegistrationParameters
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.overlap.AllAgainstAllOverlap<V> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.overlap.OverlapDetection<V>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.AllenOMEZarrLoader.OMEZARREntry (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.AllenOMEZarrProperties (implements bdv.img.n5.N5Properties)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.range.AllInRange<V> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.range.RangeComparator<V>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.global.AllToAllGUI (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.global.GlobalGUI)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Analyze_Errors (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.AnalyzeErrorPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror.AnalyzeErrorsUtil
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror.AnalyzeErrorsUtil.GroupPairResult
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror.AnalyzeErrorsUtil.PairError
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror.AnalyzeErrorsUtil.Parameters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror.AnalyzeErrorsUtil.SingleGroupError
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror.AnalyzeErrorsUtil.SingleViewError
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Apply_Transformation (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.apply.ApplyParameters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ApplyTransformationPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.AxisAngle4d (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.AxisAngle4f (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.parameters.BasicRegistrationParameters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.bdv.BDVColors
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.bdv.BDVFlyThrough
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.bdv.BDVFlyThrough.AffineTransform3DAdapter (implements com.google.gson.JsonDeserializer<T>, com.google.gson.JsonSerializer<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.bdv.BDVFlyThrough.MyTarget (implements bdv.viewer.render.RenderTarget<R>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.BDVPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.BDVSourceNaming
  • util.BDVTools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.bdv.BDVUtils
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.apply.BigDataViewerTransformationWindow
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.apply.BigDataViewerTransformationWindow.ApplyButtonListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.apply.BigDataViewerTransformationWindow.CancelButtonListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.util.BioformatsReaderUtils
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.tps.BlendingFunction3D<D,F> (implements net.imglib2.algorithm.blocks.dfield.PositionFieldFunction<D,T,F,P>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.BlendingRealRandomAccess (implements net.imglib2.RealRandomAccess<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.BlendingRealRandomAccessible (implements net.imglib2.RealRandomAccessible<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.BlkAffineFusion
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.BlkThinPlateSplineFusion
  • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.BlockGeneratorFixedSizePrecise (implements net.preibisch.mvrecon.process.cuda.BlockGenerator<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.BlockGeneratorVariableSizePrecise (implements net.preibisch.mvrecon.process.cuda.BlockGenerator<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.BlockGeneratorVariableSizeSimple (implements net.preibisch.mvrecon.process.cuda.BlockGenerator<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.BlockSorter
  • util.BlockSupplierUtils
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.grouping.Bool
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.boundingbox.BoundingBox (implements java.lang.Comparable<T>, net.imglib2.Interval)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.boundingbox.BoundingBoxGUI
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.boundingbox.AutomaticReorientationBoundingBoxGUI
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.boundingbox.BDVBoundingBoxGUI
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.boundingbox.MaximumBoundingBoxGUI
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.boundingbox.MinFilterThresholdBoundingBoxGUI
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.boundingbox.ModifyDefinedBoundingBoxGUI
  • net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxBigDataViewer (implements net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxEstimation)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.boundingbox.BoundingBoxes
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.boundingbox.BoundingBoxGUI.ManageListeners
  • net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxMaximal (implements net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxEstimation)
  • net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxMaximalGroupOverlap<V> (implements net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxEstimation)
  • net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxMinFilterThreshold (implements net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxEstimation)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.BoundingBoxPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxReorientation (implements net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxEstimation)
  • net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxTools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.CalibratedImg<T>
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.Calibration
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.centerofmass.CenterOfMassPairwise<I> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.MatcherPairwise<I>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.centerofmass.CenterOfMassParameters
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.Coefficients (implements java.io.Serializable)
  • util.ColorStream
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weightcombination.CombineWeightsRandomAccessibleInterval (implements net.imglib2.RandomAccessibleInterval<T>)
  • java.awt.Component (implements java.awt.image.ImageObserver, java.awt.MenuContainer, java.io.Serializable)
    • java.awt.Canvas (implements javax.accessibility.Accessible)
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.MyMultiLineLabel
    • java.awt.Container
      • javax.swing.JComponent (implements java.io.Serializable)
        • javax.swing.AbstractButton (implements java.awt.ItemSelectable, javax.swing.SwingConstants)
          • javax.swing.JMenuItem (implements javax.accessibility.Accessible, javax.swing.MenuElement)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.AnalyzeErrorPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ApplyTransformationPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.BakeManualTransformationPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.BDVPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.BasicBDVPopup, net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.BoundingBoxPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.DeconvolutionPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.DetectInterestPointsPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.FlatFieldCorrectionPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.FusionPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.InterestPointsExplorerPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • javax.swing.JMenu (implements javax.accessibility.Accessible, javax.swing.MenuElement)
              • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.DisplayFusedImagesPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
              • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.DisplayRawImagesPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
              • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.IntensityAdjustmentPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
              • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.MissingViewsPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
              • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.PointSpreadFunctionsPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
              • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RemoveDetectionsPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
              • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RemoveTransformationPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
              • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ResavePopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.LazyBDVPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.BasicBDVPopup, net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.MaxProjectPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.QualityPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RegisterInterestPointsPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RegistrationExplorerPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ReorientSamplePopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.SimpleHyperlinkPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.SpecifyCalibrationPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.VisualizeDetectionsPopup (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.VisualizeNonRigid (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
        • javax.swing.JLabel (implements javax.accessibility.Accessible, javax.swing.SwingConstants)
          • javax.swing.table.DefaultTableCellRenderer (implements java.io.Serializable, javax.swing.table.TableCellRenderer)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.interestpoint.InterestPointExplorerPanel.MyRenderer
          • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.LabelPopUp (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
        • javax.swing.JPanel (implements javax.accessibility.Accessible)
          • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.FilteredAndGroupedExplorerPanel<AS> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ExplorerWindow<AS>, net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.GroupedRowWindow)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ViewSetupExplorerPanel<AS> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ExplorerWindow<AS>)
          • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.interestpoint.InterestPointExplorerPanel
          • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.registration.RegistrationExplorerPanel
        • javax.swing.JSeparator (implements javax.accessibility.Accessible, javax.swing.SwingConstants)
          • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.Separator (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable)
      • java.awt.Window (implements javax.accessibility.Accessible)
        • java.awt.Dialog
          • javax.swing.JDialog (implements javax.accessibility.Accessible, javax.swing.RootPaneContainer, javax.swing.WindowConstants)
            • bdv.tools.DelayedPackDialog
              • bdv.tools.brightness.BrightnessDialog
                • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.bdv.ScrollableBrightnessDialog
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.selection.SelectionDialog
        • java.awt.Frame (implements java.awt.MenuContainer)
          • javax.swing.JFrame (implements javax.accessibility.Accessible, javax.swing.RootPaneContainer, javax.swing.WindowConstants)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror.AnalyzeErrorsResultsWindow
            • org.jfree.chart.ui.ApplicationFrame (implements java.awt.event.WindowListener)
              • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.histogram.Histogram
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.statistics.GraphFrame (implements java.awt.event.ActionListener)
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.viewneighbours.ViewNeighboursWindow
            • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.viewneighbours.ViewOverlapWindow
  • net.preibisch.legacy.registration.threshold.ComponentProperties
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.mul.ComputeBlockMulThreadCPUFactory (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.ComputeBlockThreadFactory<C>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.sequential.ComputeBlockSeqThreadCPUFactory (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.ComputeBlockThreadFactory<C>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.sequential.ComputeBlockSeqThreadCUDAFactory (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.ComputeBlockThreadFactory<C>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.ComputeBlockThread.IterationStatistics
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.ComputeBlockThreadAbstract (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.ComputeBlockThread)
    • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.mul.ComputeBlockMulThreadAbstract (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.mul.ComputeBlockMulThread)
      • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.mul.ComputeBlockMulThreadCPU
    • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.sequential.ComputeBlockSeqThreadAbstract (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.sequential.ComputeBlockSeqThread)
      • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.sequential.ComputeBlockSeqThreadCPU
      • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.sequential.ComputeBlockSeqThreadCUDA
  • net.preibisch.legacy.registration.threshold.ConnectedComponent
  • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.ConsensusSetCriterion (implements net.preibisch.mvrecon.process.splitting.OctTreeSplitCriterion)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.ContentBased
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.ContentBasedFFTRealRandomAccessible<T> (implements net.imglib2.RealRandomAccessible<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.ContentBasedRealRandomAccessible (implements net.imglib2.RealRandomAccessible<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.convergence.ConvergenceStrategy
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.convergence.IterativeConvergenceStrategy
      • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.convergence.SimpleIterativeConvergenceStrategy
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.CorrespondenceTools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.CorrespondingInterestPoints (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.CreateFromCorrespondencesParameters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.CreateFromCorresponding_Detections (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.CreateInterestPointsFromCorrespondences
  • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.CrossViewCorrespondenceCriterion (implements net.preibisch.mvrecon.process.splitting.OctTreeSplitCriterion)
  • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.CUDADevice (implements java.lang.Comparable<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.CUDASeparableConvolutionFunctions
  • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.CUDATools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.util.CZIReaderSetupHook (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.util.BioformatsReaderSetupHook)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.metadatarefinement.CZITileOrAngleRefiner (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.metadatarefinement.TileOrAngleRefiner)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Data_Explorer (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.DatasetCreationUtils
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.DeconView
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.DeconViewPSF
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.DeconViews
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.DeconvolutionGUI (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.FusionExportInterface)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.mul.DeconvolutionMethods
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.sequential.DeconvolutionMethods
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.DeconvolutionPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Define_Bounding_Box (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Define_Multi_View_Dataset (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.DefineDataSet
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.LightSheetZ1
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.MicroManager
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackList
      • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackListImageJ
      • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackListLOCI
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.DefineDataSetParameters
  • net.preibisch.mvrecon.process.chromaticabberation.DetectChromaticAbberation
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.DetectInterestPointsPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.DHM (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MultiViewDatasetDefinition)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.DHMMetaData
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.DisplacementFieldN5Tools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Display_View (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.DisplayFusedImagesPopup.DisplayVirtualFused (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.export.DisplayImage (implements net.preibisch.mvrecon.process.export.Calibrateable, net.preibisch.mvrecon.process.export.ImgExport)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.DisplayRawImagesPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.DistanceHistogram
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods.dog.DoG
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods.dog.DoGImgLib2
  • net.preibisch.legacy.registration.bead.laplace.DoGMaximum
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.DoGWindow
  • net.preibisch.mvrecon.process.downsampling.Downsample
  • net.preibisch.mvrecon.process.downsampling.DownsampleTools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Duplicate_Transformation (implements ij.plugin.PlugIn)
  • mpicbg.spim.data.generic.base.Entity
    • mpicbg.spim.data.generic.base.NamedEntity
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.EmptyEntity
  • net.preibisch.mvrecon.process.export.ExportLarge2DTIFF (implements net.preibisch.mvrecon.process.export.ImgExport)
  • net.preibisch.mvrecon.process.export.ExportN5Api (implements net.preibisch.mvrecon.process.export.Calibrateable, net.preibisch.mvrecon.process.export.ImgExport)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.FastLinearIntensityMap
  • util.FFTConvolution<R>
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinition (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MultiViewDatasetDefinition)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinition.SimpleDirectoryFileListChooser (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinition.FileListChooser)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinition.WildcardFileListChooser (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinition.FileListChooser)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinitionUtil
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinitionUtil.AngleInfo
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinitionUtil.ChannelInfo
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinitionUtil.ChannelOrIlluminationInfo
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinitionUtil.TileInfo
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinitionUtil.TileOrAngleInfo
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListViewDetectionState
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.filemap2.FileMapEntry
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.filemap2.FileMapImgLoaderLOCI2 (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.filemap2.FileMapGettable, mpicbg.spim.data.sequence.ImgLoader)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.filemap2.FileMapImgLoaderLOCI2.FileMapSetupImgLoaderLOCI2<T> (implements mpicbg.spim.data.sequence.SetupImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.FilteredAndGroupedExplorer<AS>
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ViewSetupExplorer<AS>
  • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.FilteredMaxDistanceSearchOnKDTree<S,T> (implements net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.IntegratingNeighborSearch<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.Filters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.FinishedButtonListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.parameters.FixMapBackParameters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.FlatFieldCorrectedRandomAccessibleIntervals
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.mpicbg.FlattenedMatches
  • net.preibisch.mvrecon.process.quality.FRC
  • net.preibisch.mvrecon.process.quality.FRCRealRandomAccessible<T> (implements net.imglib2.RealRandomAccessible<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.quality.FRCTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.fastrgldm.FRGLDMMatcher<I>
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.fastrgldm.FRGLDMPairwise<I> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.MatcherPairwise<I>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.fastrgldm.FRGLDMParameters
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.FusedRandomAccessibleInterval (implements net.imglib2.RandomAccessibleInterval<T>)
    • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.util.FusedNonZeroRandomAccessibleInterval
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.FusionGUI (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.FusionExportInterface)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.FusionPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.FusionTools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave.Generic_Resave_HDF5 (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave.Generic_Resave_HDF5.LoopBack2d (implements bdv.export.ExportScalePyramid.LoopbackHeuristic)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave.Generic_Resave_HDF5.ParametersResaveHDF5
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.queryXML.GenericLoadParseQueryXML<AS,S,V,D,L,X>
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.queryXML.LoadParseQueryXML
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.geometrichashing.GeometricHasher<I>
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.geometrichashing.GeometricHashingPairwise<I> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.MatcherPairwise<I>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.geometrichashing.GeometricHashingParameters
  • net.preibisch.legacy.registration.bead.error.GlobalErrorStatisticsImpl (implements net.preibisch.legacy.registration.bead.error.GlobalErrorStatistics)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.GlobalOpt
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.global.GlobalOptimizationParameters
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.GlobalOptIterative
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.GlobalOptTwoRound
  • util.Grid
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.grouping.Group<V> (implements java.lang.Iterable<T>, java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.Subset<V>
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.parameters.GroupParameters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.GUIHelper
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.HelperFunctions
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.icp.ICP<P>
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Image_Deconvolution (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Image_Fusion (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Image_Quality (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.strong.ImageCorrelationPointMatchCreator (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.PointMatchCreator)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.ImagePlusListener (implements fiji.tool.SliceListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.ImagePortion
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.ImgLib2Temp
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.ImgLib2Temp.ValuePair<A,B> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.ImgLib2Temp.Pair<A,B>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.ImgLib2Temp.ValueTriple<A,B,C> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.ImgLib2Temp.Triple<A,B,C>)
  • util.ImgLib2Tools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.global.IndividualTimepointGUI (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.global.GlobalGUI)
  • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.IntegratingNeighborSearchInterpolatorFactory<T> (implements net.imglib2.interpolation.InterpolatorFactory<T,F>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Intensity_Adjustment (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensityadjust.IntensityAdjuster (implements net.imglib2.converter.Converter<A,B>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.IntensityAdjustmentPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.intensityadjust.IntensityAdjustments
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensityadjust.IntensityAdjustmentTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.IntensityCorrection
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.IntensityCorrection.SerializableRealInterval (implements net.imglib2.RealInterval, java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.InteractiveDoG
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.InteractiveDoGParams
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.InteractiveProjections
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.InteractiveProjections.FinishedButtonListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.InteractiveProjections.RemoveInsideROIButtonListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Interest_Point_Detection (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Interest_Point_Registration (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.InterestPointDetectionGUI
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.DifferenceOfGUI
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.DifferenceOfGaussianGUI (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.GenericDialogAppender)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.interestpoint.InterestPointExplorer<AS> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.SelectedViewDescriptionListener<AS>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.grouping.InterestPointGrouping<V> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.grouping.Grouping<V,X>)
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.grouping.InterestPointGroupingAll<V>
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.grouping.InterestPointGroupingMinDistance<V>
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.strong.InterestPointMatchCreator (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.PointMatchCreator)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.interestpoint.InterestPointOverlay (implements bdv.viewer.OverlayRenderer, bdv.viewer.TransformListener<A>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods.InterestPointParameters
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods.dog.DoGParameters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.InterestPoints
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.InterestPointsN5
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.InterestPointsExplorerPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.InterestPointsN5.InterestPointData (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.InterestPointTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.InterpolatingNonRigidRasteredRandomAccessible<T> (implements net.imglib2.RandomAccessible<T>)
  • net.preibisch.legacy.io.IOFunctions
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.IPL
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.icp.IterativeClosestPointPairwise<I> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.MatcherPairwise<I>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.icp.IterativeClosestPointParameters
  • net.preibisch.legacy.mpicbg.Java3d
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.tps.Landmarks
  • net.preibisch.legacy.registration.bead.laplace.LaPlaceFunctions
  • util.Lazy
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.lazy.LazyAffineFusion<T> (implements java.util.function.Consumer<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.LazyBDVPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.downsampling.lazy.LazyDownsample2x<T> (implements java.util.function.Consumer<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.lazy.LazyFusionTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods.lazygauss.LazyGauss<T> (implements java.util.function.Consumer<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.downsampling.lazy.LazyHalfPixelDownsample2x<T> (implements java.util.function.Consumer<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.LazyLoadingFlatFieldCorrectionMap<IL> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.FlatfieldCorrectionWrappedImgLoader<IL>)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.DefaultFlatfieldCorrectionWrappedImgLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.ImgLoader)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.MultiResolutionFlatfieldCorrectionWrappedImgLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.MultiResolutionImgLoader)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.lazy.LazyNonRigidFusion<T> (implements java.util.function.Consumer<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.smartspim.LazySmartSpimLoader (implements java.util.function.Consumer<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods.lazygauss.LazyWeightedGauss<T> (implements java.util.function.Consumer<T>)
  • mpicbg.spim.data.legacy.LegacyImgLoaderWrapper<T,I> (implements mpicbg.spim.data.sequence.ImgLoader)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.DHMImgLoader
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.FileMapImgLoaderLOCI (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.filemap2.FileMapGettable)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.LightSheetZ1ImgLoader
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.MicroManagerImgLoader
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.StackImgLoader<I>
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.StackImgLoaderIJ
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.StackImgLoaderLOCI
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.LightSheetZ1 (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MultiViewDatasetDefinition)
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.LightSheetZ1MetaData
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.similarity.LinearDistance (implements net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.similarity.SimilarityMeasure)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.Link<T>
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.loadcorrespondences.LoadCorrespondencesPairwise<I> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.MatcherPairwise<I>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.Localization
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.ManageDeconvolutionDialogListeners
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.ManageFusionDialogListeners
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.ManageQualityDialogListeners
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.similarity.ManhattanDistance (implements net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.similarity.SimilarityMeasure)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.tps.MaskingFunction3D<D,T,F,P> (implements net.imglib2.algorithm.blocks.dfield.PositionFieldFunction<D,T,F,P>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.MatcherPairwiseTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.MatcherPairwiseTools.MatchingTask<V> (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.mpicbg.MatchIndices
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Matrix3d (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Matrix3f (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Matrix4d (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Matrix4f (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Max_Project (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.linkremoval.MaxErrorLinkRemoval (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.linkremoval.LinkRemovalStrategy)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.MaxProjectPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.weak.MetaDataWeakLinkFactory (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.weak.WeakLinkFactory)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MicroManager (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MultiViewDatasetDefinition)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.util.Mirror
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.MissingViewsPopup.MarkMissingListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.MissingViewsPopup.MarkMissingRemoveMetadataListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.MissingViewsPopup.MarkPresentListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.MissingViewsTableModelDecorator<AS> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ISpimDataTableModel<AS>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.grid.ModelGrid (implements net.imglib2.RealRandomAccessible<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.grid.ModelGridAccess (implements net.imglib2.RealRandomAccess<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.grid.ModelGridTools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.apply.ModelLink
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.bdv.MonotoneCubicSpline
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.statistics.MouseListenerTimelapse (implements org.jfree.chart.ChartMouseListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.histogram.MouseListenerValue (implements org.jfree.chart.ChartMouseListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.MouseOverPopUpStateChanger (implements java.awt.event.ActionListener, java.awt.event.MouseListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.MultipageTiffReader
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.MultipageTiffReader
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.MultipageTiffReader.IFDData
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.MultipageTiffReader.IFDData
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.MultipageTiffReader.IFDEntry
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.MultipageTiffReader.IFDEntry
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interactive.MultiResolutionSource (implements bdv.viewer.Source<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interactive.MultiResolutionTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.MultiViewDeconvolution<C>
    • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.MultiViewDeconvolutionMul
    • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.MultiViewDeconvolutionSeq
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.MultiViewTableModelDecorator<AS> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ISpimDataTableModel<AS>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.MultiWindowLayoutHelper
  • net.preibisch.mvrecon.process.n5api.N5ApiTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.n5api.N5ApiTools.MultiResolutionLevelInfo (implements java.io.Serializable)
  • bdv.img.n5.N5ImageLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.MultiResolutionImgLoader, bdv.ViewerImgLoader)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.AllenOMEZarrLoader
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.NamePattern
  • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.NativeLibraryTools
  • net.imglib2.neighborsearch.NearestNeighborSearchOnKDTree<T> (implements net.imglib2.neighborsearch.NearestNeighborSearch<T>)
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.NearestNeighborMaxDistanceSearchOnKDTree<T>
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.metadatarefinement.NikonND2TileOrAngleRefiner (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.metadatarefinement.TileOrAngleRefiner)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.NonRigidParameters
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.NonRigidParametersGUI
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.NonRigidRasteredRandomAccessible<T> (implements net.imglib2.RandomAccessible<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.NonRigidTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.NonRigidWeightTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.normalization.NormalizingRandomAccessibleInterval<T> (implements net.imglib2.RandomAccessibleInterval<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.NumberUtils
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.grid.NumericAffineModel3D (implements net.imglib2.type.NativeType<T>, net.imglib2.type.numeric.NumericType<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.grid.NumericAffineTransform3D (implements net.imglib2.type.NativeType<T>, net.imglib2.type.numeric.NumericType<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.patterndetector.NumericalFilenamePatternDetector (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.patterndetector.FilenamePatternDetector)
  • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.OctTreeSplitCriterion.SplitCorrespondence
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.OMEZARR (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MultiViewDatasetDefinition)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.OMEZARR.MultipleOMEZARRListChooser (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.OMEZARR.URIListChooser)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.OMEZARR.WildcardDirectoryListChooser (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.OMEZARR.URIListChooser)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.OMEZarrAttributes
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.OpenImg
  • net.preibisch.mvrecon.process.export.OpenSeaDragon (implements net.preibisch.mvrecon.process.export.ImgExport)
  • net.preibisch.mvrecon.process.export.OpenSeaDragon.OpenSeaDragonImgLib2 (implements gov.nist.isg.pyramidio.PartialImageReader)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.pairwise.PairwiseGUI
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.pairwise.CenterOfMassGUI
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.pairwise.FRGLDMGUI
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.pairwise.GeometricHashingGUI
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.pairwise.IterativeClosestPointGUI
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.pairwise.LoadCorrespondencesGUI
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.pairwise.RGLDMGUI
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.PairwiseLinkImpl (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.PairwiseLinkInterface)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.PairwiseResult<I>
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.PairwiseSetup<V>
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.AllToAllRange<V,R>
      • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.AllToAll<V>
      • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.IndividualTimepoints
      • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.ReferenceTimepoint
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.PairwiseStitchingResult<C>
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.PairwiseStitchingResult.CrossCorrelationPairwiseQualityMeasure (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.PairwiseStitchingResult.PairwiseQualityMeasure)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.PairwiseStrategyTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.overlap.ParallelepipedOverlap
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave.ParametersResaveN5Api
  • net.preibisch.legacy.io.ParsePattern
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.PluginHelper
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.PluginHelper.ChooseDirectoryListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.PluginHelper.ChooseXmlFileListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • mpicbg.models.Point (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.legacy.registration.detection.AbstractDetection<T> (implements fiji.util.node.Leaf<N>)
      • net.preibisch.legacy.registration.detection.Detection
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.InterestPoint (implements net.imglib2.RealLocalizable, java.io.Serializable)
      • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.grouping.GroupedInterestPoint<V>
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.InterestPointValue
      • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.LinkedInterestPoint<P>
    • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.LinkedPoint<P>
    • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.mpicbg.Point1D
    • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.test.PointNode (implements fiji.util.node.Leaf<N>)
  • mpicbg.models.PointMatch (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.mpicbg.PointMatch1D
    • net.preibisch.legacy.mpicbg.PointMatchGeneric<P>
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.QualityPointMatch
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.pointspreadfunctions.PointSpreadFunction
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.pointspreadfunctions.PointSpreadFunctions
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.util.ProcessInputImages<V>
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave.ProgressWriterIJ (implements bdv.export.ProgressWriter)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.PSF_Assign (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.PSF_Average (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.PSF_Extract (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.PSF_View (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.process.psf.PSFCombination
  • net.preibisch.mvrecon.process.psf.PSFExtraction<T>
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.util.PSFPreparation
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitAvgApprox (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInit)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitAvgApproxFactory (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFactory)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitAvgApproxThread (implements java.util.concurrent.Callable<V>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitAvgPrecise (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInit)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitAvgPreciseFactory (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFactory)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitAvgPreciseThread (implements java.util.concurrent.Callable<V>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitBlurredFused (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInit)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitBlurredFusedFactory (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFactory)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitBlurredFusedThread (implements java.util.concurrent.Callable<V>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFromFile (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInit)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFromFileFactory (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFactory)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFromRAI (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInit)
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFromRAIFactory (implements net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFactory)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.QualityGUI (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.FusionExportInterface)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.QualityPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.matcher.Quaternion
  • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.RadiusSearchFilter<S,T> (implements net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.Filter<T>)
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.DensityFilter<T>
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.GaussianFilter<S,T>
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.MeanFilter<S,T>
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.MedianFilter<T>
  • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.RadiusSearchFilterFactory<S,T> (implements net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.FilterFactory<S,T>)
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.DensityFilterFactory<T>
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.GaussianFilterFactory<S,T>
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.MeanFilterFactory<S,T>
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.MedianFilterFactory<T>
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.ransac.RANSAC
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.ransac.RANSACParameters
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.mpicbg.RansacRegressionReduceFilter
  • util.RealViews
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.range.ReferenceTimepointRange<V> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.range.RangeComparator<V>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RegisterInterestPointsPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.registration.RegistrationExplorer<AS> (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.SelectedViewDescriptionListener<AS>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RegistrationExplorerPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.statistics.RegistrationStatistics (implements java.lang.Comparable<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.grid.RegularTranformHelpers
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.grid.RegularTranformHelpers.GridPreset
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.grid.RegularTranformHelpers.RegularTranslationParameters
  • net.preibisch.legacy.registration.bead.laplace.RejectStatistics
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.RelativeDistanceHistogram
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.RelativeThinOut
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.RelativeThinOut_Detections (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RemoveDetectionsPopup.CreateFromCorrespondencesListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RemoveDetectionsPopup.HistogramListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RemoveDetectionsPopup.InteractiveListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RemoveDetectionsPopup.RelativeDistanceHistogramListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RemoveDetectionsPopup.RelativeThinOutListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RemoveDetectionsPopup.ThinOutListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.RemoveIntensity_Adjustment (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.RemoveTransformationPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.Render
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ReorientSamplePopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave.Resave_HDF5 (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave.Resave_N5Api (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave.Resave_TIFF (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.resave.Resave_TIFF.ParametersResaveAsTIFF
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.ResaveImaris
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ResavePopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.export.RetryTracker<T>
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.Rewrite_LuxendoXML (implements java.util.concurrent.Callable<V>, ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.rgldm.RGLDMMatcher<I>
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.rgldm.RGLDMPairwise<I> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.MatcherPairwise<I>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.methods.rgldm.RGLDMParameters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.ROIListener (implements java.awt.event.MouseListener)
  • util.S3Tools
  • net.preibisch.mvrecon.process.export.Save3dTIFF (implements net.preibisch.mvrecon.process.export.Calibrateable, net.preibisch.mvrecon.process.export.ImgExport)
  • net.preibisch.legacy.registration.bead.SegmentationBenchmark
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Show_Histogram (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Show_Relative_Histogram (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.SigmaListener (implements java.awt.event.AdjustmentListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.overlap.SimpleBoundingBoxOverlap<V> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.overlap.OverlapDetection<V>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.SimpleInfoBox
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.matcher.SimpleMatcher (implements net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.matcher.Matcher)
    • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.matcher.ModelPriorMatcher
  • net.preibisch.legacy.segmentation.SimplePeak
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.icp.SimplePointMatchIdentification<P> (implements net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.icp.PointMatchIdentification<P>)
  • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.util.SimpleRealLocalizable (implements net.imglib2.RealLocalizable)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.SimpleReferenceIP (implements net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.NonrigidIP)
    • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.CorrespondingIP
  • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.util.SimpleSampler<T> (implements net.imglib2.Sampler<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.SimView (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MultiViewDatasetDefinition)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.SimView.DirectoryFilter (implements java.io.FilenameFilter)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.SimViewImgLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.ImgLoader)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.SimViewMetaData
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.SimViewMetaData.Pattern
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.SimViewMetaData.SimViewChannel
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.SimViewSetupImgLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.SetupImgLoader<T>)
  • net.preibisch.legacy.mpicbg.SketchTikZFileObject
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.SmartSPIM (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MultiViewDatasetDefinition)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.SmartSPIM.SmartSPIMMetaData
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.SmartSPIMImgLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.ImgLoader)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.SmartSPIMSetupImgLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.SetupImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Specify_Calibration (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Specify_Calibration.Cal
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.SpecifyCalibrationPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.n5api.SpimData2Tools
  • net.preibisch.mvrecon.process.n5api.SpimData2Tools.InstantiateViewSetupBigStitcher (implements net.preibisch.mvrecon.process.n5api.SpimData2Tools.InstantiateViewSetup)
  • net.preibisch.mvrecon.process.n5api.SpimData2Tools.InstantiateViewSetupBigStitcherSpark (implements net.preibisch.mvrecon.process.n5api.SpimData2Tools.InstantiateViewSetup)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.SpimDataExample
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.SpimDataTools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Split_Views (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplitDistributeEvenly (implements net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplitView)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting.SplitImgLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.ImgLoader)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.SplitImgLoaderThinPlateSplineFusion
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.SplitImgLoaderThinPlateSplineFusion.DonatedNail (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.blk.SplitImgLoaderThinPlateSplineFusion.LandmarkRecord (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting.SplitMultiResolutionImgLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.MultiResolutionImgLoader)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting.SplitMultiResolutionSetupImgLoader<T> (implements mpicbg.spim.data.sequence.MultiResolutionSetupImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplitOctTree (implements net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplitView)
  • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplitResult (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplitOctTree.OctTreeSplitResult
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting.SplitSetupImgLoader<T> (implements mpicbg.spim.data.sequence.SetupImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplittingTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplittingTools.SetupSplitResult
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting.SplitViewerImgLoader (implements mpicbg.spim.data.sequence.MultiResolutionImgLoader, bdv.ViewerImgLoader)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting.SplitViewerSetupImgLoader<T,V> (implements mpicbg.spim.data.sequence.MultiResolutionSetupImgLoader<T>, bdv.ViewerSetupImgLoader<T,V>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.similarity.SquareDistance (implements net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.similarity.SimilarityMeasure)
  • util.StackingRealRandomAccessible<T> (implements net.imglib2.RealRandomAccessible<T>)
  • util.StackingRealRandomAccessible.StackingRealRandomAccess (implements net.imglib2.RealRandomAccess<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.StackList (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MultiViewDatasetDefinition)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.StackListImageJ
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.StackListLOCI
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.StackList.Calibration
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackList.Calibration
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.StackList.ViewSetupPrecursor
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackList.ViewSetupPrecursor
  • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackListParameters
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.StitchingResults (implements net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.PairwiseLinkInterface)
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.matcher.SubsetMatcher (implements net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.matcher.Matcher)
    • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.matcher.ModelPriorSubsetMatcher
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Switch_Attributes (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.test.TestPointDescriptor
  • net.preibisch.legacy.io.TextFileAccess
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.ThinOut
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.ThinOut_Detections (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.ThinOutParameters
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointremoval.RelativeThinOutParameters
  • net.preibisch.mvrecon.Threads
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.ThresholdListener (implements java.awt.event.AdjustmentListener)
  • java.lang.Throwable (implements java.io.Serializable)
    • java.lang.Exception
      • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.exception.NoSuitablePointsException
      • java.lang.RuntimeException
        • net.preibisch.mvrecon.vecmath.SingularMatrixException
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.statistics.TimeLapseDisplay
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.range.TimepointRange<V> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.range.RangeComparator<V>)
  • java.util.TimerTask (implements java.lang.Runnable)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.apply.BigDataViewerTransformationWindow.BDVChecker
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Transform3D
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.TransformationModelGUI
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.TransformationTools
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.TransformedInputGeneralRandomAccessible<T> (implements net.imglib2.RandomAccessible<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.TransformedInputRandomAccess2d<T> (implements net.imglib2.Localizable, net.imglib2.RandomAccess<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weights.TransformedRasteredRandomAccessible<T> (implements net.imglib2.RandomAccessible<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.TransformView
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.TransformVirtual
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.TransformWeight
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Tuple3d (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Point3d (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Vector3d (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Tuple3f (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Color3f (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Point3f (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Vector3f (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Tuple3i (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Point3i (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Tuple4d (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Point4d (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Quat4d (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Vector4d (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Tuple4f (implements java.lang.Cloneable, java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Point4f (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Quat4f (implements java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.vecmath.Vector4f (implements java.io.Serializable)
  • util.URITools
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.VectorUtil
  • net.preibisch.mvrecon.Version
  • mpicbg.spim.data.sequence.ViewId (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.GroupedViews
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.ViewInterestPointLists
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.ViewInterestPoints
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.ViewNeighbors
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.ViewPairCoefficientMatches (implements java.io.Serializable)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.ViewPairCoefficientMatchesIO
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ViewSetupExplorerInfoBox<AS>
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ViewSetupIdOverlay (implements bdv.viewer.OverlayRenderer, bdv.viewer.TransformListener<A>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.ViewSetupUtils
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.grid.VirtualGrid (implements net.imglib2.RandomAccessibleInterval<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.test.VirtualPointNode<P> (implements net.imglib2.RealLocalizable)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Visualize_Detections (implements ij.plugin.PlugIn)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Visualize_Detections.Params
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.VisualizeDetectionsPopup.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.VisualizeIntensityCorrection
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.VisualizeNonRigid.MyActionListener (implements java.awt.event.ActionListener)
  • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.weak.WeakLinkPointMatchCreator<M> (implements net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.PointMatchCreator)
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.weak.MetaDataWeakLinkCreator<N>
  • java.awt.event.WindowAdapter (implements java.awt.event.WindowFocusListener, java.awt.event.WindowListener, java.awt.event.WindowStateListener)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.FrameListener
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoAllenOMEZarrLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoDHMImgLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoFileListImgLoaderLOCI (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.filemap2.XmlIOFileMapImgLoaderLOCI2 (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.XmlIoFlatfieldCorrectedWrappedImgLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.XmlIoFlatfieldCorrectedWrappedImgLoaderMR
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoLightSheetZ1ImgLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoMicroManagerImgLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoSimViewImgLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • mpicbg.spim.data.generic.base.XmlIoSingleton<T>
    • mpicbg.spim.data.generic.XmlIoAbstractSpimData<S,T>
      • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.XmlIoSpimData2
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.boundingbox.XmlIoBoundingBoxes
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.intensityadjust.XmlIoIntensityAdjustments
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.pointspreadfunctions.XmlIoPointSpreadFunctions
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.XmlIoStitchingResults
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.XmlIoViewInterestPoints
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoSmartSPIMImgLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting.XmlIoSplitImgLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting.XmlIoSplitMultiResolutionImgLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.splitting.XmlIoSplitViewerImgLoader (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoStackImgLoader<T> (implements mpicbg.spim.data.generic.sequence.XmlIoBasicImgLoader<T>)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoStackImgLoaderIJ
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.XmlIoStackImgLoaderLOCI
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.boundingbox.XmlKeysBoundingBox
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.intensityadjust.XmlKeysIntensityAdjustments
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.interestpoints.XmlKeysInterestPoints
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.pointspreadfunctions.XmlKeysPointSpreadFunctions
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.XmlKeysStitchingResults
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.XMLSaveAs (implements ij.plugin.PlugIn)

Interface Hierarchy

• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.BasicBDVPopup
• mpicbg.spim.data.generic.sequence.BasicImgLoader
  • mpicbg.spim.data.sequence.ImgLoader
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.flatfield.FlatfieldCorrectionWrappedImgLoader<IL>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.util.BioformatsReaderSetupHook
• net.preibisch.mvrecon.process.cuda.BlockGenerator<T>
• net.preibisch.mvrecon.process.boundingbox.BoundingBoxEstimation
• net.preibisch.mvrecon.process.export.Calibrateable
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.ComputeBlockThread
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.mul.ComputeBlockMulThread
  • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.sequential.ComputeBlockSeqThread
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.iteration.ComputeBlockThreadFactory<C>
• net.preibisch.legacy.registration.detection.descriptor.CorrespondenceExtraction<T>
• net.imglib2.EuclideanSpace
  • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.render.IntegratingNeighborSearch<T>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ExplorerWindow<AS>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.popup.ExplorerWindowSetable
• net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinition.FileListChooser
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.imgloaders.filemap2.FileMapGettable
• net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.patterndetector.FilenamePatternDetector
• net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.Filter<T>
• net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.FilterFactory<S,T>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.FusionExportInterface
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.GenericDialogAppender
• net.preibisch.legacy.registration.bead.error.GlobalErrorStatistics
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.global.GlobalGUI
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.GroupedRowWindow
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.grouping.Grouping<V,X>
• net.preibisch.mvrecon.process.export.ImgExport
• net.preibisch.mvrecon.fiji.ImgLib2Temp.Pair<A,B>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.ImgLib2Temp.Triple<A,B,C>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.interestpoint.InterestPointOverlay.InterestPointSource
• com.sun.jna.Library
  • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.CUDAStandardFunctions
    • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.CUDAFourierConvolution
    • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.CUDASeparableConvolution
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.linkremoval.LinkRemovalStrategy
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.matcher.Matcher
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.MatcherPairwise<I>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.util.MouseOverPopUpStateChanger.StateChanger
• net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.MultiViewDatasetDefinition
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.nonrigid.NonrigidIP
• net.preibisch.mvrecon.process.splitting.OctTreeSplitCriterion
• net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.OMEZARR.URIListChooser
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.overlap.OverlapDetection<V>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.PairwiseLinkInterface
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.stitchingresults.PairwiseStitchingResult.PairwiseQualityMeasure
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.PointMatchCreator
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.icp.PointMatchIdentification<P>
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInit
• net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInitFactory
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.pairwise.constellation.range.RangeComparator<V>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.SelectedViewDescriptionListener<AS>
• net.preibisch.mvrecon.process.pointcloud.pointdescriptor.similarity.SimilarityMeasure
• net.preibisch.mvrecon.process.n5api.SpimData2Tools.InstantiateViewSetup
• net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplitInterval
• net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplittingTools.CorrespondenceSaver
• net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplittingTools.InterestPointSaver
• net.preibisch.mvrecon.process.splitting.SplitView
• net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.StitchingResultsSettable
• javax.swing.table.TableModel
  • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ISpimDataTableModel<AS>
• net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.metadatarefinement.TileOrAngleRefiner
• net.preibisch.mvrecon.process.fusion.intensity.UnbleachFunction
• net.preibisch.mvrecon.process.interestpointregistration.global.pointmatchcreating.weak.WeakLinkFactory

Enum Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.lang.constant.Constable, java.io.Serializable)
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror.AnalyzeErrorsResultsWindow.BdvResetPolicy
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.analyzeerror.AnalyzeErrorsUtil.Mode
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.parameters.BasicRegistrationParameters.InterestPointOverlapType
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.parameters.BasicRegistrationParameters.OverlapType
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.parameters.BasicRegistrationParameters.RegistrationType
    • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.weightcombination.CombineWeightsRandomAccessibleInterval.CombineType
    • net.preibisch.mvrecon.process.splitting.ConsensusSetCriterion.ToleranceMode
    • net.preibisch.mvrecon.process.cuda.CUDASeparableConvolutionFunctions.OutOfBounds
    • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.DeconViewPSF.PSFTYPE
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.DefineDataSetParameters.RotationAxis
    • net.preibisch.mvrecon.process.interestpointdetection.methods.dog.DoGImgLib2.SpecialPoint
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.datasetmanager.FileListDatasetDefinitionUtil.CheckResult
    • net.preibisch.mvrecon.process.quality.FRC.ThresholdMethod
    • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.transformed.FusedRandomAccessibleInterval.Fusion
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.fusion.FusionGUI.FusionType
    • net.preibisch.mvrecon.process.fusion.FusionTools.ImgDataType
    • net.preibisch.mvrecon.imglib2.st.filter.GaussianFilterFactory.WeightType
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.global.GlobalOptimizationParameters.GlobalOptType
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.global.GlobalOptimizationParameters.PreAlign
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointregistration.parameters.GroupParameters.InterestpointGroupingType
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.interestpointdetection.interactive.InteractiveDoG.ValueChange
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.ISpimDataTableModel.SpecialColumnType
    • net.preibisch.mvrecon.process.deconvolution.init.PsiInit.PsiInitType
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.plugin.Split_Views.InterestPointAdding
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackListParameters.AngleOption
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackListParameters.ChannelOption
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackListParameters.Container
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackListParameters.IlluminationOption
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackListParameters.TileOption
    • net.preibisch.mvrecon.headless.definedataset.StackListParameters.TimePointOption
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.viewneighbours.ViewNeighboursWindow.ResetPolicy
    • net.preibisch.mvrecon.fiji.spimdata.explorer.viewneighbours.ViewOverlapWindow.ResetPolicy